基因设计常见问题
2021-07-28
1、为什么要进行全基因合成?
最常见的获得目的基因的方法是PCR扩增钓取基因。但很多的时候,扩增只会得到痕量或根本就得不到目的基因。如果用这种方法,首先,必须准备某一特定组织的cDNA文库,就必须花时间去准备或订购。其次,目的基因在文库中的含量必须充足,否则就可能会找不到合适的方法钓取或克隆得到。第三,PCR扩增得到的目的基因可能会含有许多点突变或单核苷酸多态性,这会给您后期的实验应用带来极大麻烦。
2、密码子优化有必要吗?
有必要。不同来源的种属密码子的偏好性不同。比如,在人体内受偏爱的密码子对于E.coli来说可能是稀有的。
3、什么是新基因?
(1)需经过密码子优化以提高外源表达量的基因。
(2)从组织样品不易获得,但序列已知的基因。
(3)需要特定突变的基因。
(4)无法通过钓鱼法获得的或cDNA文库中不表达、丰度极低、很难通过PCR法获取的基因。
(5)用于微芯片的大量cDNA。
(6)您所感兴趣的、自然界中还不存在对应蛋白表达与纯化的新基因。
最常见的获得目的基因的方法是PCR扩增钓取基因。但很多的时候,扩增只会得到痕量或根本就得不到目的基因。如果用这种方法,首先,必须准备某一特定组织的cDNA文库,就必须花时间去准备或订购。其次,目的基因在文库中的含量必须充足,否则就可能会找不到合适的方法钓取或克隆得到。第三,PCR扩增得到的目的基因可能会含有许多点突变或单核苷酸多态性,这会给您后期的实验应用带来极大麻烦。
2、密码子优化有必要吗?
有必要。不同来源的种属密码子的偏好性不同。比如,在人体内受偏爱的密码子对于E.coli来说可能是稀有的。
3、什么是新基因?
(1)需经过密码子优化以提高外源表达量的基因。
(2)从组织样品不易获得,但序列已知的基因。
(3)需要特定突变的基因。
(4)无法通过钓鱼法获得的或cDNA文库中不表达、丰度极低、很难通过PCR法获取的基因。
(5)用于微芯片的大量cDNA。
(6)您所感兴趣的、自然界中还不存在对应蛋白表达与纯化的新基因。